От началото на менструацията, жената започва да измерва сутрешната температура след сън. Той се измерва най-често под езика, а около 12 дни базовата температура ще бъде около 36,5 градуса. Тогава е възможно леко спадане на базовата температура за един ден и с началото на овулацията графиката се променя: тогава базовата температура се повишава с 0,4 градуса или повече - от 37 градуса (а може би и 37 - 38, за различните жени, по различни начини). Това се случва преди менструацията, преди което има второ понижение на базовата температура.
Когато жената оплоди яйце, базовата температура не пада при забавяне на менструацията, тя е над 37 градуса, но няма менструация. Понякога при имплантиране на ембриона основната температура дори прави остър скок нагоре (37-38 градуса). Всичките му промени могат да бъдат информативни до 20 седмици от бременността, те обикновено не измерват по-нататък.
Не винаги базалната температура веднага скача по време на бременността, само че не пада, а месечната не започва. След зачеването обикновено започва повишаване на основната температура по време на бременност, което продължава повече от 18 дни (варира от 37,1 до 37,3 градуса).
Ако повишаването на базовата температура по време на бременност е вариант на нормата, то нейното намаляване е много лош прогностичен признак. Намаляването на основната температура по време на диагностициране на бременността може да покаже неразвита бременност и смъртта на ембриона. Но базовата температура е информативна само по време на ранна бременност (до 20 седмици), от тогава започва да намалява отново. След 21 седмици на бременността, основната температура обикновено е под 37 градуса и сега това изобщо не е знак за опасност от спонтанен аборт.
Ако след началото на бременността базовата температура леко се понижи, това може да означава намаляване на нивото на прогестерон и заплаха от спонтанен аборт. Но ако базовата температура падне до 0.8-1 градуса и остане на това ниво, тогава това е знак за пропуснат аборт и незабавно трябва да се подложите на ултразвуков преглед (проверете дали оплоденото яйце и ембрионът расте, ако има сърцебиене и движение на плода). Базова температура при приемане на Dufaston или Utrogestan може да продължи известно време да се увеличава и при развиваща се бременност.